Базуються основні «стандартні» процедури виділення бактеріальної ДНК розщеплення клітинної стінки лізоцимом, лізис детергентів, руйнування комплексів білок-нуклеїнова кислота та екстракція фенол:хлороформ для видалення білків.
Існує п’ять основних етапів екстракції ДНК, узгоджених для всіх можливих хімічних процесів очищення ДНК: 1) руйнування клітинної структури для створення лізату, 2) відділення розчинної ДНК від залишків клітини та іншого нерозчинного матеріалу, 3) зв’язування ДНК, що представляє інтерес для матриці очищення, 4) …
Екстракція NaOH був ефективним для грамнегативних і грампозитивних бактерій у зразках повітря, ґрунту, стічних вод, харчових продуктів, лабораторних поверхонь і курячих мазків з клоаки. Метод екстракції NaOH можна порівняти з комерційними наборами для екстракції ДНК із зразків фекалій свиней для аналізу секвенування амплікону 16S.
Процес складається з п'яти кроків: зв'язування з матрицею, зв'язування NTP, ініціація, подовження праймера та перенесення праймера до ДНК-полімерази III. DnaG має зв’язуватися з геліказою DnaB, щоб синтезувати праймери поблизу вилки реплікації.
Екстракція ДНК є метод очищення ДНК за допомогою фізичних та/або хімічних методів із зразка, що відокремлює ДНК від клітинних мембран, білків та інших клітинних компонентів. Фрідріх Мішер у 1869 році вперше зробив виділення ДНК.
Екстракція ДНК — це процес, у якому ДНК відокремлюється від білків, мембран та іншого клітинного матеріалу (Батлер, 2012). За Райсом (2018), метод включає три необхідні кроки, а саме: лізис, осадження та очищення.