Що таке коалесцентна байєсовська лінія горизонту?

0 Comments 11:59

The Коалесцентний

Коалесцентний

Коалесцентна теорія є модель того, як алелі, відібрані з популяції, могли походити від спільного предка.

https://en.wikipedia.org › wiki › Коалесцентна_теорія

Байєсівський горизонт ділить час між поточним моментом і коренем дерева (tMRCA) на сегменти та оцінює інший ефективний розмір популяції ( N e N_e Ne) для кожного сегмента.

Акцент у коалесцентному мисленні є щоб переглянути популяції назад у часі, використовуючи розбіжності, які спостерігаються в популяції, щоб оцінити час до останнього спільного предка (MRCA); цей предок є точкою, де генні генеалогії збираються разом або «зливаються» в одному біологічному організмі.

Отже, середній час злиття двох випадково вибраних генів становить T=2N. Ефективний розмір коалесцентної популяції відноситься до очікуваного часу коалесценції T, у поколіннях, копій генів так, що T=2Ne (Nordborg and Krone, 2002; Wakeley and Sargsyan, 2009).

Розширений байєсівський графік горизонту (EBSP, Heled and Drummond 2008) є модифікацією BSP, що підтримується в BEAST, у якому генетичні дані посилаються на кожну подію злиття, щоб оцінити новий ефективний розмір популяції за допомогою відбору байєсівської стохастичної змінної.

У найпростішому випадку коалесцентна теорія не передбачає жодної рекомбінації, природного відбору та потоку генів чи структури популяції, що означає, що кожен варіант з однаковою ймовірністю передається від одного покоління до наступного.

Теоретичне об’єднання — це метод теоретичного розширення, індуктивного дослідження, розвитку теорії, який використовує дані (а не теми, категорії та опубліковані витяги даних) як основне джерело для аналізу.

Багатовидовий коалесцент (MSC) описує розподіл ймовірностей дерева генів G, що лежить в основі зразка послідовностей ДНК двох або більше видів. (або генетично ізольовані популяції). MSC є розширенням коалесцентної теорії для однієї популяції, яка випадково спаровується.

Related Post

Яка анатомія кістково-м’язової системи?Яка анатомія кістково-м’язової системи?

Кістки, м'язи та суглоби складають кістково-м'язову систему разом із хрящами, сухожиллями та зв'язками. Ця система надає вашому тілу структуру та підтримку, дозволяє пересуватися та захищає важливі органи. Травми та багато