Руффало одружився Sunrise Coigney у 2000 році. Мають трьох дітей. Після завершення роботи над фільмом «Останній замок» у Руффало діагностували вестибулярну шванному, тип пухлини головного мозку, також відомий як акустична неврома.
Одружений майже 24 роки, Койні та Руффало мають трьох дітей. Вона працювала акторкою та підприємцем, а також є мамою повний робочий день, і Руффало віддає їй всю заслугу в успіху сім’ї.
Санрайз Коігні Марк Руффало називає дружину Санрайз «усім, чого я міг хотіти, і більше» Руффало поділився щирою даниною на честь їхньої 24-ї річниці весілля. Марк Руффало відзначає віху з дружиною Sunrise Coigney.
У актора Халка та його дружини Санрайз Коігні, з якою вони прожили понад 20 років, народилася перша дитина. син Кін, 2001 р. Пізніше у них народилося дві дочки: Белла в 2005 році і Одетта в 2007 році.
Пухлина була доброякісною, і зрештою він видалив її хірургічним шляхом, але Марк закінчився "зовсім глухий» на одне вухо. Після операції у актора «Прожектора» також стався параліч лівої сторони обличчя. «Я навіть не міг закрити ока», — сказав він.