Багато з цих зареєстрованих випадків показують, що транспозони можуть впливати на транскрипцію генів, і спостерігалося принаймні п’ять класів механізмів: забезпечення цис-елементів, вплив на тривимірну архітектуру хроматину, виробництво регуляторних некодуючих РНК (нкРНК), кооптація як частина регуляторних білків і викликають…
Зсувні елементи можуть активно перебудовують структуру хроматину регулювати експресію генів протягом тривалого періоду часу. Було виявлено, що близько 10% сімейств TE збагачені активними геномними ділянками в цілому та в різних органах.
Насправді транспозони можуть стимулювати еволюцію геномів, сприяючи транслокації геномних послідовностей, перетасовці екзонів і ремонту дволанцюгових розривів. Вставки та транспозиція також можуть змінюють регуляторні ділянки та фенотипи генів.
Наприклад, ДНК-транспозони можуть інактивують або змінюють експресію генів шляхом вставки в інтрони, екзони або регуляторні ділянки 14. Крім того, ТЕ можуть брати участь у реорганізації геному шляхом мобілізації нетранспозонної ДНК 18 або діючи як субстрати рекомбінації.
Вони можуть викликати мутації кількома способами: Якщо транспозон вставляється у функціональний ген, він, ймовірно, пошкодить його. Вставка в екзони, інтрони та навіть у ДНК, що оточує гени (яка може містити промотори та енхансери), може зруйнувати або змінити активність гена.
Зокрема, експресія генів контролюється на двох рівнях. по-перше, транскрипція контролюється обмеженням кількості мРНК, яка виробляється з певного гена. Другий рівень контролю відбувається через посттранскрипційні події, які регулюють трансляцію мРНК у білки.