В імунології конформаційний епітоп – це послідовність субодиниць (зазвичай амінокислот), що утворюють антиген, які безпосередньо контактують з рецептором імунної системи.
Лінійні епітопи складаються з безперервних залишків білкової послідовності. Конформаційні епітопи складаються із залишків, які є розривними в білковій послідовності, але знаходяться в безпосередній близькості, щоб утворити антигенну поверхню на тривимірній структурі білка.
Безперервні або лінійні епітопи складаються з безперервної послідовності амінокислотних залишків на основі первинної структури білка, у той час як розривні або конформаційні епітопи складають розривну послідовність амінокислотних залишків, які об’єднуються шляхом згортання білка через його нативну вторинну структуру. ..
Існує три типи епітопу: конформаційні, лінійні та розривні. Ця класифікація базується на їхній структурі та взаємодії з паратопом антитіла. Конформаційні епітопи утворюються шляхом взаємодії від’єднаних один від одного амінокислотних залишків.
Епітопи зазвичай діляться на дві категорії: лінійні епітопи, де для зв’язування достатньо відрізка безперервних амінокислот, і конформаційні епітопи, де ключові амінокислотні залишки об’єднуються шляхом згортання білка [5].
Хоча B-клітини та антитіла зазвичай розпізнають конформаційні епітопи з поверхневих білків, Т-клітини розпізнають лінійні епітопи, отримані з білків, які обробляються APC.