1543 року Мехмед несподівано вмирає. На думку деяких дослідників, Мехмед помер від віспи. Спочатку Мехмед був похований у мечеті Баезід.
Він упав жертвою кривавих перегонів за владу, жертвою зрадницького вчинку свого наближеного, який виконував накази Махідевран (Нур Феттахоглу).
Сарухан-Шехзаде Мехмед / Місце смертіСарухан – санджак, адміністративно-територіальна одиниця Османської імперії в 1410-1923 р.р. Столиця – Маніса. Вікіпедія
Згідно з історичними джерелами, він був сином Румейси Султан і відразу після смерті батька хлопчика вирішили посадити на трон Османа, і саме з цієї причини султан Сулейман прийняв рішення стратити Мехмеда через удушення.